El clima en Atapuerca, en Burgos, se caracteriza por ser de tipo mediterráneo continentalizado, con marcadas diferencias entre estaciones. Los inviernos suelen ser fríos, con temperaturas que bajan notablemente, mientras que los veranos alcanzan temperaturas más elevadas, especialmente en julio, aunque el mes más seco es agosto, lo que favorece periodos de tiempo más estable y cálido. La primavera y el otoño son estaciones de transición, en las que las lluvias aumentan, siendo mayo el mes más lluvioso, principalmente por la influencia de sistemas atmosféricos que aportan precipitaciones moderadas y distribuidas a lo largo de la estación. La estación más seca, en cambio, es el verano, con menos lluvias y temperaturas agradables para actividades al aire libre, sobre todo en los meses de junio y septiembre. La meteorología de Atapuerca refleja un contraste notable entre el frío invierno y el verano más seco y cálido, con un patrón que favorece un clima variable pero con periodos de estabilidad en verano.
Normales climáticas WorldClim 2.1 para el periodo 1970–2025.