El clima en Desojo, en la comunidad foral de Navarra, se caracteriza por ser mediterráneo continentalizado, con marcadas diferencias entre las estaciones. Los inviernos suelen ser fríos, especialmente en enero, mientras que los veranos, en particular en julio, tienden a ser cálidos y secos. La influencia de la ubicación interior favorece un contraste notable entre el verano y el invierno, con temperaturas que alcanzan su punto más alto en agosto y las más bajas en enero.
La meteorología de Desojo muestra que la primavera es la estación más lluviosa, con lluvias concentradas en estos meses, mientras que en verano las precipitaciones son escasas, haciendo que sea la época más seca del año. La distribución de las lluvias, junto con las temperaturas extremas, determina que las épocas más agradables para actividades al aire libre sean en primavera y en otoño, cuando el tiempo suele ser más templado y estable. La influencia geográfica de la zona contribuye a un clima que combina secas veranos con inviernos fríos y húmedos en la estación primaveral.
Normales climáticas WorldClim 2.1 para el periodo 1970–2025.