El clima en El Frago se caracteriza por ser mediterráneo continentalizado, con una marcada diferencia entre las estaciones. Los inviernos son fríos, especialmente en enero, mientras que los veranos alcanzan su máxima calidez en agosto, con temperaturas que invitan a disfrutar de actividades al aire libre en los meses más cálidos. La primavera es la estación más lluviosa, aportando cierta humedad que favorece la vegetación, aunque en verano las precipitaciones son escasas, haciendo que los periodos secos sean más prolongados.
La influencia de la ubicación en la provincia de Zaragoza, en una zona interior y elevada, modera las temperaturas extremas, pero también acentúa la amplitud térmica anual. La meteorología de El Frago muestra que la época más agradable para actividades al aire libre suele ser la primavera, cuando el tiempo es más benigno y las lluvias aportan un verdor característico a la comarca. La distribución de las lluvias y las temperaturas refleja un clima que combina la influencia mediterránea con un marcado carácter continental, propio de la región.
Normales climáticas WorldClim 2.1 para el periodo 1970–2025.