El clima en Lantarón se caracteriza por ser mediterráneo continentalizado, con inviernos fríos y veranos cálidos, reflejando la influencia de su ubicación en el interior de la provincia de Araba. Las temperaturas experimentan un marcado contraste entre las estaciones, siendo enero el mes más frío y agosto el más cálido, lo que contribuye a un tiempo en Lantarón con cambios acusados a lo largo del año.
Las precipitaciones se concentran principalmente en primavera, siendo abril el mes más lluvioso, mientras que en verano, especialmente en julio, las lluvias son escasas, haciendo que esta estación sea la más seca. La meteorología de Lantarón favorece un período más agradable para actividades al aire libre en los meses de verano, aunque la primavera también ofrece un clima más benigno. La distribución de las lluvias y las temperaturas contribuyen a un paisaje que combina periodos de sequía con episodios de mayor humedad, propios del clima mediterráneo continentalizado en esta zona del País Vasco.
Normales climáticas WorldClim 2.1 para el periodo 1970–2025.