El clima en Muñopedro se caracteriza por ser mediterráneo continentalizado, con marcadas diferencias entre estaciones. Los veranos suelen ser secos y calurosos, especialmente en agosto, mientras que los inviernos presentan temperaturas frías, alcanzando su punto más bajo en enero. La influencia de la altitud y la ubicación en el interior de la provincia de Segovia acentúan estos contrastes térmicos, haciendo que las temperaturas extremas sean frecuentes en ambas estaciones.
Las lluvias en Muñopedro son más abundantes durante la primavera, que es la estación más lluviosa, aportando un alivio a los meses más secos del verano. La época más agradable para actividades al aire libre suele coincidir con la primavera y principios del verano, cuando las temperaturas son moderadas y la meteorología tiende a ser más estable. La distribución de las precipitaciones refleja un patrón típico de clima mediterráneo interior, con inviernos fríos y veranos secos, condicionado por la influencia del relieve y la continentalidad de la zona.
Normales climáticas WorldClim 2.1 para el periodo 1970–2025.