El clima en Navalcán se enmarca dentro de un tipo mediterráneo continentalizado, caracterizado por contrastes marcados entre estaciones. Los inviernos suelen ser fríos, con temperaturas que bajan notablemente, mientras que los veranos se presentan calurosos y secos, especialmente en julio, que es el mes más seco del año. La influencia de su ubicación en el interior de Castilla-La Mancha contribuye a unas condiciones climáticas más extremas en comparación con las zonas costeras, con inviernos más largos y veranos muy calurosos.
Las lluvias se concentran principalmente en la estación invernal, siendo diciembre el mes más lluvioso, lo que favorece un período más húmedo y fresco. La meteorología de Navalcán suele ser estable durante la primavera y principios del verano, aunque la estación más agradable para actividades al aire libre suele ser la primavera, cuando las temperaturas son moderadas y las precipitaciones aún son frecuentes. En general, el clima en Navalcán refleja un equilibrio entre el rigor del invierno y la sequedad del verano, condicionado por su ubicación interior y la influencia del relieve circundante.
Normales climáticas WorldClim 2.1 para el periodo 1970–2025.