El clima en Pueblonuevo del Guadiana se caracteriza por ser mediterráneo continentalizado, con inviernos fríos y veranos calurosos. La diferencia de temperaturas entre ambas estaciones es notable, reflejando un marcado contraste que influye en la meteorología de la zona. Durante los meses más cálidos, en julio, las temperaturas alcanzan su punto máximo, mientras que en enero el frío se hace más presente, siendo el mes más frío del año.
Las precipitaciones en Pueblonuevo del Guadiana se concentran principalmente en invierno, siendo diciembre el mes más lluvioso, mientras que en verano, especialmente en julio, el clima resulta más seco y las lluvias escasas. La influencia de la altitud y la orientación hacia el interior peninsular contribuyen a un patrón climático con inviernos húmedos y veranos secos, siendo la primavera y el otoño temporadas agradables para actividades al aire libre, con temperaturas moderadas y menor incidencia de precipitaciones. La meteorología de Pueblonuevo del Guadiana refleja un equilibrio entre el carácter continental y la influencia mediterránea, que marca su clima en general.
Normales climáticas WorldClim 2.1 para el periodo 1970–2025.