El clima en Quer se enmarca dentro de un patrón mediterráneo continentalizado, caracterizado por inviernos fríos y veranos calurosos. La diferencia entre estaciones es notable, con temperaturas que alcanzan su punto más alto en julio y se reducen considerablemente en enero, reflejando el marcado contraste térmico típico de esta zona interior de Castilla-La Mancha.
Las precipitaciones se concentran principalmente en otoño, siendo noviembre el mes más lluvioso, mientras que en verano la sequía predomina, con julio como el período más seco. La meteorología de Quer se ve influida por su ubicación, con un clima que favorece actividades al aire libre durante la primavera y principios del otoño, cuando las temperaturas son más agradables y las lluvias aún no dificultan el tiempo en Quer. La distribución de las lluvias y las temperaturas extremas definen un paisaje que combina periodos secos con episodios de precipitación en otoño, aportando variedad a su clima mediterráneo continentalizado.
Normales climáticas WorldClim 2.1 para el periodo 1970–2025.